| Ident. | Authors (with country if any) | Title |
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| 000380 (2020) |
Liang Xiao [République populaire de Chine] ; Xin Liu [République populaire de Chine] ; Wenjie Lu [République populaire de Chine] ; Panfei Chen [République populaire de Chine] ; Mingyang Quan [République populaire de Chine] ; Jingna Si [République populaire de Chine] ; Qingzhang Du [République populaire de Chine] ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] | Genetic dissection of the gene coexpression network underlying photosynthesis in Populus. |
| 000658 (2019) |
Longxin Wang [République populaire de Chine] ; Jianbo Xie [République populaire de Chine] ; Qingzhang Du [République populaire de Chine] ; Fangyuan Song [République populaire de Chine] ; Liang Xiao [République populaire de Chine] ; Mingyang Quan [République populaire de Chine] ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] | Transcription factors involved in the regulatory networks governing the Calvin-Benson-Bassham cycle. |
| 000827 (2019) |
Hari B. Chhetri [États-Unis] ; David Macaya-Sanz [États-Unis] ; David Kainer [États-Unis] ; Ajaya K. Biswal [États-Unis] ; Luke M. Evans [États-Unis] ; Jin-Gui Chen [États-Unis] ; Cassandra Collins [États-Unis] ; Kimberly Hunt [États-Unis] ; Sushree S. Mohanty [États-Unis] ; Todd Rosenstiel [États-Unis] ; David Ryno [États-Unis] ; Kim Winkeler [États-Unis] ; Xiaohan Yang [États-Unis] ; Daniel Jacobson [États-Unis] ; Debra Mohnen [États-Unis] ; Wellington Muchero [États-Unis] ; Steven H. Strauss [États-Unis] ; Timothy J. Tschaplinski [États-Unis] ; Gerald A. Tuskan [États-Unis] ; Stephen P. Difazio [États-Unis] | Multitrait genome-wide association analysis of Populus trichocarpa identifies key polymorphisms controlling morphological and physiological traits. |
| 000929 (2019) |
Jin-Gui Liu [République populaire de Chine] ; Xiao Han [République populaire de Chine] ; Tong Yang [République populaire de Chine] ; Wen-Hui Cui [République populaire de Chine] ; Ai-Min Wu [République populaire de Chine] ; Chun-Xiang Fu [République populaire de Chine] ; Bai-Chen Wang [République populaire de Chine] ; Li-Jun Liu [République populaire de Chine] | Genome-wide transcriptional adaptation to salt stress in Populus. |
| 000A43 (2019) |
Pei Sun [République populaire de Chine] ; Huixia Jia [République populaire de Chine] ; Yahong Zhang [République populaire de Chine] ; Jianbo Li [République populaire de Chine] ; Mengzhu Lu [République populaire de Chine] ; Jianjun Hu [République populaire de Chine] | Deciphering Genetic Architecture of Adventitious Root and Related Shoot Traits in Populus Using QTL Mapping and RNA-Seq Data. |
| 000A61 (2019) |
Yan Zhang [République populaire de Chine] ; Zheng'Ang Xiao [République populaire de Chine] ; Chang Zhan [République populaire de Chine] ; Meifeng Liu [République populaire de Chine] ; Wenxiu Xia [République populaire de Chine] ; Nian Wang [République populaire de Chine] | Comprehensive analysis of dynamic gene expression and investigation of the roles of hydrogen peroxide during adventitious rooting in poplar. |
| 000B65 (2019) |
Chung-Shu Yeh [Taïwan] ; Zhifeng Wang [République populaire de Chine] ; Fang Miao [Taïwan] ; Hongyan Ma [République populaire de Chine] ; Chung-Ting Kao [Taïwan] ; Tzu-Shu Hsu [Taïwan] ; Jhong-He Yu [Taïwan] ; Er-Tsi Hung [Taïwan] ; Chia-Chang Lin [Taïwan] ; Chen-Yu Kuan [Taïwan] ; Ni-Chiao Tsai [Taïwan] ; Chenguang Zhou [République populaire de Chine] ; Guan-Zheng Qu [République populaire de Chine] ; Jing Jiang [République populaire de Chine] ; Guifeng Liu [République populaire de Chine] ; Jack P. Wang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Wei Li [République populaire de Chine] ; Vincent L. Chiang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Tien-Hsien Chang [Taïwan] ; Ying-Chung Jimmy Lin [République populaire de Chine, Taïwan, États-Unis] | A novel synthetic-genetic-array-based yeast one-hybrid system for high discovery rate and short processing time. |
| 000C24 (2018) |
Matthew Zinkgraf [États-Unis] ; Suzanne Gerttula [États-Unis] ; Shutang Zhao [République populaire de Chine] ; Vladimir Filkov [États-Unis] ; Andrew Groover [États-Unis] | Transcriptional and temporal response of Populus stems to gravi-stimulation. |
| 000E34 (2018) |
H Earl Petzold [États-Unis] ; Stephen B. Rigoulot [États-Unis] ; Chengsong Zhao [États-Unis] ; Bidisha Chanda [États-Unis] ; Xiaoyan Sheng [États-Unis] ; Mingzhe Zhao [États-Unis, République populaire de Chine] ; Xiaoyan Jia [États-Unis] ; Allan W. Dickerman [États-Unis] ; Eric P. Beers [États-Unis] ; Amy M. Brunner [États-Unis] | Identification of new protein-protein and protein-DNA interactions linked with wood formation in Populus trichocarpa. |
| 000E65 (2018) |
Jin Zhang [États-Unis] ; Yongil Yang [États-Unis] ; Kaijie Zheng [États-Unis] ; Meng Xie [États-Unis] ; Kai Feng [États-Unis] ; Sara S. Jawdy [États-Unis] ; Lee E. Gunter [États-Unis] ; Priya Ranjan [États-Unis] ; Vasanth R. Singan [États-Unis] ; Nancy Engle [États-Unis] ; Erika Lindquist [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Jeremy Schmutz [États-Unis] ; Nan Zhao [États-Unis] ; Timothy J. Tschaplinski [États-Unis] ; Jared Leboldus [États-Unis] ; Gerald A. Tuskan [États-Unis] ; Jin-Gui Chen [États-Unis] ; Wellington Muchero [États-Unis] | Genome-wide association studies and expression-based quantitative trait loci analyses reveal roles of HCT2 in caffeoylquinic acid biosynthesis and its regulation by defense-responsive transcription factors in Populus. |
| 000E69 (2018) |
Shao-Wei Qin [République populaire de Chine] ; Ren-Jun Jiang [République populaire de Chine] ; Na Zhang [République populaire de Chine] ; Zhan-Wen Liu [République populaire de Chine] ; Cai-Lin Li [République populaire de Chine] ; Zhong-Zhong Guo [République populaire de Chine] ; Liang-Hong Bao [République populaire de Chine] ; Li-Feng Zhao [République populaire de Chine] | Genome-wide analysis of RNAs associated with Populus euphratica Oliv. heterophyll morphogenesis. |
| 001080 (2018) |
Rajesh Kumar Singh [Suède] ; Jay P. Maurya [Suède] ; Abdul Azeez [Suède, États-Unis] ; Pal Miskolczi [Suède] ; Szymon Tylewicz [Suède, Suisse] ; Katja Stojkovi [Suède] ; Nicolas Delhomme [Suède] ; Victor Busov [États-Unis] ; Rishikesh P. Bhalerao [Suède] | A genetic network mediating the control of bud break in hybrid aspen. |
| 001090 (2018) |
Zhong Chen [République populaire de Chine] ; Pian Rao [République populaire de Chine] ; Xiaoyu Yang [République populaire de Chine] ; Xiaoxing Su [République populaire de Chine] ; Tianyun Zhao [République populaire de Chine] ; Kai Gao [République populaire de Chine] ; Xiong Yang [République populaire de Chine] ; Xinmin An [République populaire de Chine, États-Unis] | A Global View of Transcriptome Dynamics During Male Floral Bud Development in Populus tomentosa. |
| 001214 (2017) |
Y. Daguerre [France, Suède] ; E. Levati [Italie] ; J. Ruytinx [France, Belgique] ; E. Tisserant [France] ; E. Morin [France] ; A. Kohler [France] ; B. Montanini [Italie] ; S. Ottonello [Italie] ; A. Brun [France] ; C. Veneault-Fourrey [France] ; F. Martin [France] | Regulatory networks underlying mycorrhizal development delineated by genome-wide expression profiling and functional analysis of the transcription factor repertoire of the plant symbiotic fungus Laccaria bicolor. |
| 001218 (2017) |
Ying-Chung Jimmy Lin [République populaire de Chine, Taïwan, États-Unis] ; Hao Chen [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Wei Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Jack P. Wang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Rui Shi [États-Unis] ; Sermsawat Tunlaya-Anukit [États-Unis] ; Peng Shuai [États-Unis, République populaire de Chine] ; Zhifeng Wang [République populaire de Chine] ; Hongyan Ma [République populaire de Chine] ; Huiyu Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Ying-Hsuan Sun [Taïwan] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] | Reciprocal cross-regulation of VND and SND multigene TF families for wood formation in Populus trichocarpa. |
| 001254 (2017) |
Ying Li [République populaire de Chine] ; Yuepeng Song [République populaire de Chine] ; Baohua Xu [République populaire de Chine] ; Jianbo Xie [République populaire de Chine] ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] ; Janice Cooke | Poplar CBF1 functions specifically in an integrated cold regulatory network. |
| 001286 (2017) |
Soile Jokipii-Lukkari [Suède] ; David Sundell [Suède] ; Ove Nilsson [Suède] ; Torgeir R. Hvidsten [Suède, Norvège] ; Nathaniel R. Street [Suède] ; Hannele Tuominen [Suède] | NorWood: a gene expression resource for evo-devo studies of conifer wood development. |
| 001348 (2017) |
Matthew Zinkgraf [États-Unis] ; Lijun Liu [États-Unis] ; Andrew Groover [États-Unis] ; Vladimir Filkov [États-Unis] | Identifying gene coexpression networks underlying the dynamic regulation of wood-forming tissues in Populus under diverse environmental conditions. |
| 001364 (2017) |
Ertugrul Filiz [Turquie] ; Recep Vatansever [Turquie] ; Ibrahim Ilker Ozyigit [Turquie] ; Mehmet Emin Uras [Turquie] ; Ugur Sen [Turquie] ; Naser A. Anjum [Portugal] ; Eduarda Pereira [Portugal] | Genome-wide identification and expression profiling of EIL gene family in woody plant representative poplar (Populus trichocarpa). |
| 001460 (2017) |
Rishi R. Masalia [États-Unis] ; Adam J. Bewick [États-Unis] ; John M. Burke [États-Unis] | Connectivity in gene coexpression networks negatively correlates with rates of molecular evolution in flowering plants. |
| 001466 (2017) |
Jingbo Jia [République populaire de Chine] ; Jing Zhou [République populaire de Chine] ; Wenguang Shi [République populaire de Chine] ; Xu Cao [République populaire de Chine] ; Jie Luo [République populaire de Chine] ; Andrea Polle [Allemagne] ; Zhi-Bin Luo [République populaire de Chine] | Comparative transcriptomic analysis reveals the roles of overlapping heat-/drought-responsive genes in poplars exposed to high temperature and drought. |
| 001638 (2016) |
Jianbo Li [République populaire de Chine] ; Jin Zhang [République populaire de Chine] ; Huixia Jia [République populaire de Chine] ; Yu Li [République populaire de Chine] ; Xiangdong Xu [République populaire de Chine] ; Lijuan Wang [République populaire de Chine] ; Mengzhu Lu [République populaire de Chine] | The Populus trichocarpa PtHSP17.8 involved in heat and salt stress tolerances. |
| 001715 (2016) |
Qi Liu [République populaire de Chine] ; Changjun Ding [République populaire de Chine] ; Yanguang Chu [République populaire de Chine] ; Jiafei Chen [République populaire de Chine] ; Weixi Zhang [République populaire de Chine] ; Bingyu Zhang [République populaire de Chine] ; Qinjun Huang [République populaire de Chine] ; Xiaohua Su [République populaire de Chine] | PoplarGene: poplar gene network and resource for mining functional information for genes from woody plants. |
| 001860 (2016) |
Jinhui Chen [République populaire de Chine] ; Jianbo Xie [République populaire de Chine] ; Beibei Chen [République populaire de Chine] ; Mingyang Quan [République populaire de Chine] ; Ying Li [République populaire de Chine] ; Bailian Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] | Genetic variations and miRNA-target interactions contribute to natural phenotypic variations in Populus. |
| 001868 (2016) |
Qingzhang Du [République populaire de Chine] ; Chenrui Gong [République populaire de Chine] ; Qingshi Wang [République populaire de Chine] ; Daling Zhou [République populaire de Chine] ; Haijiao Yang [République populaire de Chine] ; Wei Pan [République populaire de Chine] ; Bailian Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] | Genetic architecture of growth traits in Populus revealed by integrated quantitative trait locus (QTL) analysis and association studies. |
| 001915 (2016) |
Liang-Jiao Xue [États-Unis] ; Christopher J. Frost [États-Unis] ; Chung-Jui Tsai [États-Unis] ; Scott A. Harding [États-Unis] | Drought response transcriptomes are altered in poplar with reduced tonoplast sucrose transporter expression. |
| 001A20 (2016) |
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| 001A91 (2015) |
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| 001B05 (2015) |
Xiaohui Yang [République populaire de Chine] ; Zunzheng Wei [République populaire de Chine] ; Qingzhang Du [République populaire de Chine] ; Jinhui Chen [République populaire de Chine] ; Qingshi Wang [République populaire de Chine] ; Mingyang Quan [République populaire de Chine] ; Yuepeng Song [République populaire de Chine] ; Jianbo Xie [République populaire de Chine] ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] | The genetic regulatory network centered on Pto-Wuschela and its targets involved in wood formation revealed by association studies. |
| 001B69 (2015) |
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| 001B92 (2015) |
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| 001D05 (2015) |
Jin Zhang [République populaire de Chine] ; Bobin Liu [République populaire de Chine] ; Jianbo Li [République populaire de Chine] ; Li Zhang [République populaire de Chine] ; Yan Wang [République populaire de Chine] ; Huanquan Zheng [Canada] ; Mengzhu Lu [République populaire de Chine] ; Jun Chen [République populaire de Chine] | Hsf and Hsp gene families in Populus: genome-wide identification, organization and correlated expression during development and in stress responses. |
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Jinhui Chen [République populaire de Chine] ; Mingyang Quan ; Deqiang Zhang | Genome-wide identification of novel long non-coding RNAs in Populus tomentosa tension wood, opposite wood and normal wood xylem by RNA-seq. |
| 001D35 (2015) |
Min Chen [République populaire de Chine] ; Zhimin Cao [République populaire de Chine] | Genome-wide expression profiling of microRNAs in poplar upon infection with the foliar rust fungus Melampsora larici-populina. |
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Lijun Liu [États-Unis] ; Trevor Ramsay [États-Unis] ; Matthew Zinkgraf [États-Unis] ; David Sundell [Suède] ; Nathaniel Robert Street [Suède] ; Vladimir Filkov [États-Unis] ; Andrew Groover [États-Unis] | A resource for characterizing genome-wide binding and putative target genes of transcription factors expressed during secondary growth and wood formation in Populus. |
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Chengwen Chen [République populaire de Chine] ; Ye Yao [République populaire de Chine] ; Liang Zhang [République populaire de Chine] ; Minjie Xu [République populaire de Chine] ; Jianping Jiang [République populaire de Chine] ; Tonghai Dou [République populaire de Chine] ; Wei Lin [République populaire de Chine] ; Guoping Zhao [République populaire de Chine] ; Minren Huang [République populaire de Chine] ; Yan Zhou [République populaire de Chine] | A Comprehensive Analysis of the Transcriptomes of Marssonina brunnea and Infected Poplar Leaves to Capture Vital Events in Host-Pathogen Interactions. |
| 002030 (2014) |
Bin Cai [République populaire de Chine] ; Cheng-Hui Li [République populaire de Chine] ; Jian Huang [République populaire de Chine] | Systematic identification of cell-wall related genes in Populus based on analysis of functional modules in co-expression network. |
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Dejuan Euring ; Hua Bai ; Dennis Janz ; Andrea Polle | Nitrogen-driven stem elongation in poplar is linked with wood modification and gene clusters for stress, photosynthesis and cell wall formation. |
| 002133 (2014) |
Antoine Harfouche [Italie] ; Richard Meilan [États-Unis] ; Arie Altman [Israël] | Molecular and physiological responses to abiotic stress in forest trees and their relevance to tree improvement. |
| 002136 (2014) |
Lijun Liu [États-Unis] ; Vladimir Filkov ; Andrew Groover | Modeling transcriptional networks regulating secondary growth and wood formation in forest trees. |
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Bowen Wang ; Qingzhang Du ; Xiaohui Yang ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] | Identification and characterization of nuclear genes involved in photosynthesis in Populus. |
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Juanjuan Liu [République populaire de Chine] ; Jianguo Zhang [République populaire de Chine] ; Caiyun He [République populaire de Chine] ; Aiguo Duan [République populaire de Chine] | Genes responsive to elevated CO2 concentrations in triploid white poplar and integrated gene network analysis. |
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Kangmei Zhao ; Laura E. Bartley [États-Unis] | Comparative genomic analysis of the R2R3 MYB secondary cell wall regulators of Arabidopsis, poplar, rice, maize, and switchgrass. |
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Sergiu Netotea ; David Sundell ; Nathaniel R. Street ; Torgeir R. Hvidsten [Suède] | ComPlEx: conservation and divergence of co-expression networks in A. thaliana, Populus and O. sativa. |
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Ying-Chung Lin [États-Unis] ; Wei Li ; Ying-Hsuan Sun ; Sapna Kumari ; Hairong Wei ; Quanzi Li ; Sermsawat Tunlaya-Anukit ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | SND1 transcription factor-directed quantitative functional hierarchical genetic regulatory network in wood formation in Populus trichocarpa. |
| 002521 (2013) |
Shanfa Lu [République populaire de Chine] ; Quanzi Li ; Hairong Wei ; Mao-Ju Chang ; Sermsawat Tunlaya-Anukit ; Hoon Kim ; Jie Liu ; Jingyuan Song ; Ying-Hsuan Sun ; Lichai Yuan ; Ting-Feng Yeh ; Ilona Peszlen ; John Ralph ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Ptr-miR397a is a negative regulator of laccase genes affecting lignin content in Populus trichocarpa. |
| 002571 (2013) |
Hairong Wei [États-Unis] ; Yordan S. Yordanov ; Tatyana Georgieva ; Xiang Li ; Victor Busov | Nitrogen deprivation promotes Populus root growth through global transcriptome reprogramming and activation of hierarchical genetic networks. |
| 002675 (2013) |
Hairong Wei [États-Unis] ; Yordan Yordanov [États-Unis] ; Sapna Kumari [États-Unis] ; Tatyana Georgieva [États-Unis] ; Victor Busov [États-Unis] | Genetic networks involved in poplar root response to low nitrogen. |
| 002748 (2013) |
Liang-Jiao Xue [États-Unis] ; Wenbing Guo ; Yinan Yuan ; Edward O. Anino ; Batbayar Nyamdari ; Mark C. Wilson ; Christopher J. Frost ; Han-Yi Chen ; Benjamin A. Babst ; Scott A. Harding ; Chung-Jui Tsai | Constitutively elevated salicylic acid levels alter photosynthesis and oxidative state but not growth in transgenic populus. |
| 002779 (2013) |
Jennifer Lockhart | Breaking down the complex regulatory web underlying lignin biosynthesis. |
| 002B49 (2012) |
Laura Baxter [Royaume-Uni] ; Aleksey Jironkin ; Richard Hickman ; Jay Moore ; Christopher Barrington ; Peter Krusche ; Nigel P. Dyer ; Vicky Buchanan-Wollaston ; Alexander Tiskin ; Jim Beynon ; Katherine Denby ; Sascha Ott | Conserved noncoding sequences highlight shared components of regulatory networks in dicotyledonous plants. |
